Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa2P31245 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa2P31245 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms