Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms