Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PrkcdP28867 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcdP28867 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms