Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxraP28700 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RxraP28700 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RxraP28700 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RxraP28700 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RxraP28700 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RxraP28700 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms