Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Defa2P28309 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa2P28309 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms