Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb3P28231 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms