Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabrg3P27681 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabrg3P27681 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms