Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfraP26618 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms