Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf1bP25119 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms