Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gria1P23818 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms