Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxd12P23812 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd12P23812 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms