Protein–RNA interactions for Protein: P23299

Kcne1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcne1P23299 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcne1P23299 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms