Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrkchP23298 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkchP23298 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms