Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp36P22893 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms