Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Clk1P22518 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clk1P22518 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clk1P22518 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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