Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms