Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ms4a2P20490 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms