Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fcer1aP20489 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fcer1aP20489 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms