Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VimP20152 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VimP20152 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VimP20152 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VimP20152 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VimP20152 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms