Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NelfeP19426 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NelfeP19426 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms