Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnnc1P19123 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnc1P19123 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms