Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms