Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtpraP18052 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpraP18052 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpraP18052 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms