Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou4f1P17208 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou4f1P17208 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou4f1P17208 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou4f1P17208 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou4f1P17208 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou4f1P17208 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou4f1P17208 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms