Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SptbP15508 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SptbP15508 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SptbP15508 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SptbP15508 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms