Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd44P15379 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd44P15379 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd44P15379 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms