Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Irf1P15314 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Irf1P15314 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Irf1P15314 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Irf1P15314 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf1P15314 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Irf1P15314 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf1P15314 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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