Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vpreb1P13372 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms