Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga5P11688 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga5P11688 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga5P11688 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms