Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DmdP11531 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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DmdP11531 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DmdP11531 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DmdP11531 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DmdP11531 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DmdP11531 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DmdP11531 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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DmdP11531 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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DmdP11531 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DmdP11531 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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DmdP11531 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DmdP11531 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DmdP11531 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms