Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp1P11438 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms