Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Tnp1P10856 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Tnp1P10856 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms