Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl3P10855 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl3P10855 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl3P10855 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccl3P10855 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms