Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxd4P10628 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms