Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Myod1P10085 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Myod1P10085 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms