Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms