Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wipf3P0C7L0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wipf3P0C7L0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms