Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb5P09079 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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