Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NefmP08553 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NefmP08553 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NefmP08553 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NefmP08553 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NefmP08553 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefmP08553 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefmP08553 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefmP08553 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefmP08553 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefmP08553 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefmP08553 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NefmP08553 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NefmP08553 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NefmP08553 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NefmP08553 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NefmP08553 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NefmP08553 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NefmP08553 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NefmP08553 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NefmP08553 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms