Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sod1P08228 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sod1P08228 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sod1P08228 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sod1P08228 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sod1P08228 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sod1P08228 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sod1P08228 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sod1P08228 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms