Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csf1P07141 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf1P07141 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms