Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnfP06804 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnfP06804 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnfP06804 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnfP06804 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnfP06804 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnfP06804 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TnfP06804 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TnfP06804 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TnfP06804 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TnfP06804 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TnfP06804 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TnfP06804 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TnfP06804 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TnfP06804 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms