Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P06324 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P06324 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P06324 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P06324 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P06324 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms