Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P04214 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P04214 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P04214 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P04214 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P04214 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P04214 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P04214 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P04214 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms