Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P04213 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P04213 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P04213 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P04213 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P04213 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P04213 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P04213 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P04213 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms