Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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H3f3cP02301 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H3f3cP02301 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H3f3cP02301 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms