Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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H2-Ab1P01921 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Ab1P01921 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Ab1P01921 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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