Protein–RNA interactions for Protein: P01795

Ig heavy chain V region M167, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01795 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01795 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01795 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01795 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01795 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01795 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01795 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01795 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01795 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01795 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01795 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms