Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01746 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01746 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01746 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01746 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01746 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01746 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01746 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01746 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01746 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01746 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01746 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01746 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms