Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Robo1O89026 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Robo1O89026 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms